Cada pessoa é geneticamente diferente entre si. Cada um de nós possui sequencias de nucleónicas diferentes. Se usar-mos as enzimas de restrição, irão formar, portanto, sectores de DNA de diferentes tamanhos, tamanhos esses que diferem de pessoa para pessoa. Ao submeter essas porções a eletroforese (aplicar numa placa um campo eléctrico, em que um extremo seja o pólo negativo, e no outro o positivo). O DNA é de carga negativa, desloca-se portanto para a extremidade positiva. As porções maiores, mais pesadas, são mais lentas e ficam para trás. As mais leves, deslocam-se mais rápido, formando assim marcas. Por comparação com outras amostras, podemos ver se pertencem ao mesmo individuo, se são progenitores, irmãos, etc.
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